代谢异常是肿瘤发生的关键因素之一。肿瘤的发生发展会导致代谢重组编程，但代谢异常先于肿瘤的发生发展。许多因素如肿瘤缺氧、基质成分、免疫细胞浸润和基因改变，在定义癌细胞代谢方面起着至关重要的作用。

细胞由正常到癌变并不是一瞬间完成的，从DNA突变、DNA表观遗传修饰到RNA编辑、蛋白质合成以及代谢物产生等，这些不同的物质在不同的时期，其实都在细胞内持续不断地产生着变化。

肿瘤现在也被认为是一种代谢疾病，代谢通路的异常和改变可以实时而灵敏地反应肿瘤的状态。因此，代谢组学的应用将给肿瘤早期筛查带来新的可能。